Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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