Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn2Q8CHX7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms