Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS8

Vps37a, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37aQ8CHS8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps37aQ8CHS8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps37aQ8CHS8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms