Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Setd1bQ8CFT2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd1bQ8CFT2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms