Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Snx8Q8CFD4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx8Q8CFD4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx8Q8CFD4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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