Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl11Q8CE33 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms