Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc17Q8CE13 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc17Q8CE13 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms