Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc187Q8C5V8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc187Q8C5V8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc187Q8C5V8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc187Q8C5V8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms