Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot2Q8C5L3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot2Q8C5L3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms