Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccser1Q8C0C4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms