Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Iffo1Q8BXL9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Iffo1Q8BXL9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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