Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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