Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a9Q8BGD6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms