Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ChfrQ810L3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChfrQ810L3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ChfrQ810L3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ChfrQ810L3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ChfrQ810L3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms