Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WhrnQ80VW5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WhrnQ80VW5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms