Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ttc29Q80VM3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms