Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sestd1Q80UK0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms