Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pja2Q80U04 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms