Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms