Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms