Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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Shq1Q7TMX5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Shq1Q7TMX5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Shq1Q7TMX5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Shq1Q7TMX5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Shq1Q7TMX5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms