Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Scn4bQ7M729 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn4bQ7M729 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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