Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GypcQ78HU7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GypcQ78HU7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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