Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms