Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms