Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms