Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja6Q6S5G4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms