Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna2d2Q6PHS9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d2Q6PHS9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms