Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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