Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc148Q6P5U8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc148Q6P5U8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms