Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RbfaQ6P3B9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms