Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slx4Q6P1D7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms