Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms