Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc66Q6NS45 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms