Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms