Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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