Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rftn1Q6A0D4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rftn1Q6A0D4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms