Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Sh3rf1Q69ZI1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Sh3rf1Q69ZI1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3rf1Q69ZI1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms