Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc2Q69ZB8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms