Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Sbno1Q689Z5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Sbno1Q689Z5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Sbno1Q689Z5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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Sbno1Q689Z5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Sbno1Q689Z5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Sbno1Q689Z5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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