Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp4eQ66X19 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp4eQ66X19 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms