Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrp9cQ66X01 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms