Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q66JV7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q66JV7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q66JV7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q66JV7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms