Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ndrg1Q62433 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ndrg1Q62433 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg1Q62433 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms