Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tdrd5Q5VCS6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tdrd5Q5VCS6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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