Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Dnajc11Q5U458 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnajc11Q5U458 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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