Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim38Q5SZ99 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim38Q5SZ99 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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