Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arhgap44Q5SSM3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arhgap44Q5SSM3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms