Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcnjlQ5SRT8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms