Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufaf2Q59J78 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms